DYCP-31DN-systemet är ett horisontellt elektroforessystem. Vid horisontell gelelektrofores gjuts en gel i horisontell riktning och nedsänks i rinnande buffert i gellådan. Gelboxen är uppdelad i två fack, med agarosgel som separerar de två. Som tidigare nämnts är en anod placerad i ena änden, medan en katod är placerad i den andra. Den joniska löpbufferten gör att en laddningsgradient kan skapas när en ström appliceras. Dessutom tjänar bufferten till att kyla gelen, som värms upp när en laddning appliceras. Löpbufferten recirkuleras ofta för att förhindra att en pH-gradient bildas. Vi har olika storlekar på kammar att använda. De olika kammarna gör detta horisontella elektroforessystem idealiskt för alla agarosgelapplikationer inklusive undervattenselektrofores, för snabb elektrofores med små mängder prover, DNA , undervattenselektrofores, för identifiering, separering och beredning av DNA, och för mäta molekylvikten.
Under elektroforesen bildas en gel i en gjutbricka. Brickan innehåller små "brunnar" som håller de partiklar du vill testa. Flera mikroliter (µL) av lösningen som innehåller de partiklar du vill testa laddas försiktigt i brunnarna. Sedan hälls en buffert, som leder elektrisk ström, i elektroforeskammaren. Därefter placeras gjutbrickan, som innehåller partiklarna, försiktigt i kammaren och nedsänks i bufferten. Slutligen stängs kammaren och strömkällan slås på. Anoden och katoden, skapade av den elektriska strömmen, drar till sig de motsatt laddade partiklarna. Partiklarna rör sig långsamt i gelén mot motsatt laddning. Strömmen stängs av och gelén tas ut och inspekteras.